AT3G08580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ADP/ATP carrier 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
mitochondrial ADP/ATP carrier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ADP/ATP carrier 1 (AAC1); FUNCTIONS IN: binding, copper ion binding, ATP:ADP antiporter activity; INVOLVED IN: transport, purine nucleotide transport; LOCATED IN: in 10 components; EXPRESSED IN: 28 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial carrier protein (InterPro:IPR002067), Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108), Adenine nucleotide translocator 1 (InterPro:IPR002113); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ADP/ATP carrier 2 (TAIR:AT5G13490.2); Has 19855 Blast hits to 12531 proteins in 484 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 8964; Fungi - 5060; Plants - 3882; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1949 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:2605706..2607030 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41477.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 381 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVDQVQHPTI AQKAAGQFMR SSVSKDVQVG YQRPSMYQRH ATYGNYSNAA FQFPPTSRML ATTASPVFVQ TPGEKGFTNF ALDFLMGGVS AAVSKTAAAP 101: IERVKLLIQN QDEMIKAGRL SEPYKGIGDC FGRTIKDEGF GSLWRGNTAN VIRYFPTQAL NFAFKDYFKR LFNFKKDRDG YWKWFAGNLA SGGAAGASSL 201: LFVYSLDYAR TRLANDAKAA KKGGGGRQFD GLVDVYRKTL KTDGIAGLYR GFNISCVGII VYRGLYFGLY DSVKPVLLTG DLQDSFFASF ALGWVITNGA 301: GLASYPIDTV RRRMMMTSGE AVKYKSSLDA FKQILKNEGA KSLFKGAGAN ILRAVAGAGV LSGYDKLQLI VFGKKYGSGG A |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)