AT2G31570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glutathione peroxidase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
glutathione peroxidase GPx | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutathione peroxidase 2 (GPX2); FUNCTIONS IN: glutathione peroxidase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, response to oxidative stress; LOCATED IN: cytosol; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336), Glutathione peroxidase (InterPro:IPR000889); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutathione peroxidase 7 (TAIR:AT4G31870.1); Has 7463 Blast hits to 7462 proteins in 1754 species: Archae - 2; Bacteria - 3597; Metazoa - 796; Fungi - 210; Plants - 383; Viruses - 8; Other Eukaryotes - 2467 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:13438211..13439775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18945.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 169 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADESPKSIY DFTVKDIGGN DVSLDQYKGK TLLVVNVASK CGLTDANYKE LNVLYEKYKE QGLEILAFPC NQFLGQEPGN NEEIQQTVCT RFKAEFPIFD 101: KVDVNGKNTA PLYKYLKAEK GGLLIDAIKW NFTKFLVSPD GKVLQRYSPR TSPLQFEKDI QTALGQASS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)