AT3G51730.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : saposin B domain-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
saposin B domain-containing protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: lipid metabolic process; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Saposin B (InterPro:IPR008139), Saposin-like (InterPro:IPR011001), Saposin-like type B, 1 (InterPro:IPR007856), Saposin-like type B, 2 (InterPro:IPR008138); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: saposin B domain-containing protein (TAIR:AT5G01800.1); Has 951 Blast hits to 460 proteins in 88 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 738; Fungi - 0; Plants - 102; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 111 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19186970..19188436 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24099.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 213 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGLKAGTFVL LLLGLILVSD ARSFVDSTIS EKVSNKEDVC TLCEEYVTDA LSYLEKNVTQ AEIIEDLHDR CSQLRGYSQQ CISLVDYYVP LFFLQLESFQ 101: PHYFCKRMNL CGKVVALVEE ARQDSCGVCH RTVSEILIKL QDPDTQLDIV ELLIKGCKSL KNYEKKCKTL VFEYGPLILV NAEEFLVKND VCTLLRACPP 201: EKSVLRQPEL ADS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)