AT3G04840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein S3Ae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein S3Ae; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: cytosolic small ribosomal subunit, cytosolic ribosome, plasma membrane, chloroplast; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S3Ae, conserved site (InterPro:IPR018281), Ribosomal protein S3Ae (InterPro:IPR001593); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein S3Ae (TAIR:AT4G34670.1); Has 1367 Blast hits to 1362 proteins in 410 species: Archae - 234; Bacteria - 1; Metazoa - 463; Fungi - 247; Plants - 191; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 231 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:1329751..1331418 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29852.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 262 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVGKNKRIS KGRKGGKKKA VDPFSKKDWY DVKAPSIFTH RNVGKTLVSR TQGTKIASEG LKHRVFEVSL ADLQGDEDNA YRKIRLRAED VQGRNVLCQF 101: WGMDFTTDKL RSLVKKWQTL IEAHVDVKTT DSYTLRLFCI AFTKRRANQV KRTCYAQSSQ IRQIRRKMRD IMVREASSCD LKDLVAKFIP EAIGREIEKA 201: TQGIYPLQNV FIRKVKILKA PKFDLGKLMD VHGDYSAEDV GVKVDRPADE MAVEEPTEII GA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)