AT4G10480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Nascent polypeptide-associated complex (NAC), alpha subunit family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Nascent polypeptide-associated complex (NAC), alpha subunit family protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal (InterPro:IPR000449), Nascent polypeptide-associated complex, alpha subunit (InterPro:IPR016641), Nascent polypeptide-associated complex NAC (InterPro:IPR002715); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-like protein 5 (TAIR:AT1G33040.1); Has 1093 Blast hits to 1084 proteins in 303 species: Archae - 64; Bacteria - 9; Metazoa - 410; Fungi - 246; Plants - 158; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 204 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:6478089..6479079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23173.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 212 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPGPVIEEVN EEALMDAIKE QMKLQKENDV VVEDVKDGDE DDDDVDDDDD EIADGAGENE ASKQSRSEKK SRKAMLKLGM KPVTDVSRVT IKRSKNVLFV 101: ISKPDVFKSP NSETYVIFGE AKIDDMSSQL QAQAAQRFKM PDVASMIPNT DGSEAATVAQ EEEDDEDVDE TGVEAKDIDL VMTQAGVSRP KAVKALKESN 201: GDIVSAIMEL TT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)