AT1G66270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Glycosyl hydrolase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
BGLU21; FUNCTIONS IN: beta-glucosidase activity, hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds; INVOLVED IN: cellular response to phosphate starvation, response to salt stress, cellular response to cold, cellular response to salt stress, response to osmotic stress; LOCATED IN: vacuole, membrane; EXPRESSED IN: root, callus, leaf; EXPRESSED DURING: seedling growth; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycoside hydrolase, family 1 (InterPro:IPR001360), Glycoside hydrolase, family 1, active site (InterPro:IPR018120), Glycoside hydrolase, catalytic core (InterPro:IPR017853), Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core (InterPro:IPR013781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glycosyl hydrolase superfamily protein (TAIR:AT1G66280.1); Has 11188 Blast hits to 10882 proteins in 1457 species: Archae - 140; Bacteria - 7714; Metazoa - 698; Fungi - 202; Plants - 1441; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 993 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:24700110..24702995 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59666.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 524 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALQKFPLMG LLLLLTILVS VTTAVDDPVC PATSKLSRAS FPNGFLFGTA TAAFQVEGAI NETCRGPALW DIYCRRNPER CSGDHADVAV DFFHRYKEDI 101: QLMKNLNTDA FRLSIAWSRI FPHGRKEKGV SQAGVQFYHE LIDELLKNGI VPFVTVFHWD TPQDLEDEYG GFLSQNIVKD FREYADYVFT EYGGKVKNWI 201: TFNEPWVFAH AGYDLGKKAP GRCSRYVPGC EDREGQSGKE AYLVSHNLLN AHAEAVEVFR QKVKGGKIGI AHSPAWFEPH DLKDSNDAPT VSRVLDFMLG 301: WHLEPTTSGD YPQIMKDLLG YRLPQFTAAQ KAKLKDSTDF VGLNYYTSTF SNYNEKPDPS KPSWKQDSLV SWEPKNVDHS AIGSMPLTAA LPVYAKGFRK 401: LLKYIKDKYA NPEIMIMENG YGDKLGTTDS VDVGTADHNR KYYLQRHLLA MNEAICIDKV RVTGYFVWSL LDNFEWQDGY KNRFGLYYVD FKNNLTRYEK 501: ESAKYYKDFL AQGVRPSALK RDEL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)