AT1G66280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Glycosyl hydrolase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
BGLU22; FUNCTIONS IN: beta-glucosidase activity, hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds; INVOLVED IN: response to salt stress, cellular response to cold, cellular response to salt stress; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: root, callus, pollen tube, leaf; EXPRESSED DURING: seedling growth; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycoside hydrolase, family 1 (InterPro:IPR001360), Glycoside hydrolase, family 1, active site (InterPro:IPR018120), Glycoside hydrolase, catalytic core (InterPro:IPR017853), Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core (InterPro:IPR013781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glycosyl hydrolase superfamily protein (TAIR:AT1G66270.1); Has 11192 Blast hits to 10883 proteins in 1464 species: Archae - 140; Bacteria - 7710; Metazoa - 697; Fungi - 202; Plants - 1444; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 999 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:24706759..24709737 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59783.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 524 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALQKFPLLG LLFLITIVVS STIAVDDPVC PTTSKLSRAS FPNGFVFGTA TAAFQVEGAI NETCRGPALW DIFCKRNPER CSGHNADVAV DFFHRYKEDI 101: QLMKNLNTDA FRLSIAWSRI FPHGRKEKGV SQAGVKFYHD LIDELLKNGI IPFVTVFHWD TPQDLEDEYG GFLSENIVKD FREYADYVFT EYGGKVKNWI 201: TFNEPWVFAH AGYDVGKKAP GRCSRYLKGC EDRDGRSGYE AYLVSHNLLN AHAEAVEVFR QKVKGGKIGI AHSPAWFEPH DLKDSNDVPT VSRVLDFMLG 301: WHLDPTTFGD YPQIMKDLLG HRLPKFTSSQ KAKLKDSTDF VGLNYYTSTF SNHNEKPDPS TPSWKQDSLV AWEPKNVDHS AIGSQPLTAA LPVYAKGFRS 401: LLKYIKDKYA NPEIMIMENG YGDKLKDKDS VEVGTADYNR KYYLQRHLLA MNEAICIDKV RVTGYFVWSL LDNFEWQDGY NNRFGLYYVD FKNNLTRYEK 501: ESAKYYKDFL GQGVRPSALK KDEL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)