AT1G16030.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : heat shock protein 70B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
heat shock protein 70B (Hsp70b); FUNCTIONS IN: ATP binding; INVOLVED IN: protein folding, response to heat; LOCATED IN: cytosol, cell wall, plasma membrane, chloroplast, membrane; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Heat shock protein 70, conserved site (InterPro:IPR018181), Heat shock protein Hsp70 (InterPro:IPR001023), Heat shock protein 70 (InterPro:IPR013126); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: heat shock protein 70 (TAIR:AT3G12580.1); Has 33913 Blast hits to 33562 proteins in 4835 species: Archae - 164; Bacteria - 16454; Metazoa - 3784; Fungi - 1785; Plants - 1262; Viruses - 309; Other Eukaryotes - 10155 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:5502386..5504326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 70918.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 646 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATKSEKAIG IDLGTTYSCV GVWMNDRVEI IPNDQGNRTT PSYVAFTDTE RLIGDAAKNQ VALNPQNTVF DAKRLIGRKF SDPSVQSDIL HWPFKVVSGP 101: GEKPMIVVSY KNEEKQFSPE EISSMVLVKM KEVAEAFLGR TVKNAVVTVP AYFNDSQRQA TKDAGAISGL NVLRIINEPT AAAIAYGLDK KGTKAGEKNV 201: LIFDLGGGTF DVSLLTIEEG VFEVKATAGD THLGGEDFDN RLVNHFVAEF RRKHKKDIAG NARALRRLRT ACERAKRTLS STAQTTIEID SLHEGIDFYA 301: TISRARFEEM NMDLFRKCMD PVEKVLKDAK LDKSSVHDVV LVGGSTRIPK IQQLLQDFFN GKELCKSINP DEAVAYGAAV QAAILTGEGS EKVQDLLLLD 401: VAPLSLGLET AGGVMTVLIP RNTTVPCKKE QVFSTYADNQ PGVLIQVYEG ERARTRDNNL LGTFELKGIP PAPRGVPQIN VCFDIDANGI LNVSAEDKTA 501: GVKNQITITN DKGRLSKEEI EKMVQDAEKY KAEDEQVKKK VEAKNSLENY AYNMRNTIKD EKLAQKLTQE DKQKIEKAID ETIEWIEGNQ LAEVDEFEYK 601: LKELEGICNP IISKMYQGGA AAGGMPTDGD FSSSGAAGGP KIEEVD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)