AT3G18690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MAP kinase substrate 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a nuclear-localized member of a plant specific gene family involved in mediating responses to pathogens. Interacts with WRKY transcriptional regulators. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MAP kinase substrate 1 (MKS1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: VQ (InterPro:IPR008889); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: VQ motif-containing protein (TAIR:AT1G21326.1); Has 153 Blast hits to 153 proteins in 16 species: Archae - 0; Bacteria - 5; Metazoa - 0; Fungi - 1; Plants - 147; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:6429755..6430423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23582.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 222 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDPSEYFAGG NPSDQQNQKR QLQICGPRPS PLSVHKDSHK IKKPPKHPAP PPNRDQPPPY IPREPVVIYA VSPKVVHATA SEFMNVVQRL TGISSGVFLE 101: SGGGGDVSPA ARLASTENAS PRGGKEPAAR DETVEINTAM EEAAEFGGYA PGILSPSPAL LPTASTGIFS PMYHQGGMFS PAIPLGLFSP AGFMSPFRSP 201: GFTSLVASPT FADFFSHIWD QD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)