AT2G30770.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
putative cytochrome P450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 13 (CYP71A13); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 12 (TAIR:AT2G30750.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:-:13109909..13112006 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 56792.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 8.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 503 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSNIQEMEMI LSISLCLTTL ITLLLLRRFL KRTATKVNLP PSPWRLPVIG NLHQLSLHPH RSLRSLSLRY GPLMLLHFGR VPILVVSSGE AAQEVLKTHD 101: HKFANRPRSK AVHGLMNGGR DVVFAPYGEY WRQMKSVCIL NLLTNKMVES FEKVREDEVN AMIEKLEKAS SSSSSENLSE LFITLPSDVT SRVALGRKHS 201: EDETARDLKK RVRQIMELLG EFPIGEYVPI LAWIDGIRGF NNKIKEVSRG FSDLMDKVVQ EHLEASNDKA DFVDILLSIE KDKNSGFQVQ RNDIKFMILD 301: MFIGGTSTTS TLLEWTMTEL IRSPKSMKKL QDEIRSTIRP HGSYIKEKEV ENMKYLKAVI KEVLRLHPSL PMILPRLLSE DVKVKGYNIA AGTEVIINAW 401: AIQRDTAIWG PDAEEFKPER HLDSGLDYHG KNLNYIPFGS GRRICPGINL ALGLAEVTVA NLVGRFDWRV EAGPNGDQPD LTEAIGIDVC RKFPLIAFPS 501: SVV |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)