AT5G19280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.809 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : kinase associated protein phosphatase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
kinase associated protein phosphatase composed of three domains: an amino-terminal signal anchor, a kinase interaction (KI) domain, and a type 2C protein phosphatase catalytic region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
kinase associated protein phosphatase (KAPP); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein phosphatase 2C, manganese/magnesium aspartate binding site (InterPro:IPR000222), SMAD/FHA domain (InterPro:IPR008984), Protein phosphatase 2C-related (InterPro:IPR001932), Kinase associated protein phosphatase (InterPro:IPR016660), Protein phosphatase 2C, N-terminal (InterPro:IPR014045), Protein phosphatase 2C (InterPro:IPR015655), Forkhead-associated (FHA) domain (InterPro:IPR000253); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HOPW1-1-interacting 2 (TAIR:AT4G31750.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:6488450..6493182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64914.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 581 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMIGMNIIG LFMVLMLLLI SLIILFACKP WRYFSRFRSS SRFSSTFKVG DLQRPLISDD GNLIQGQTSE VTREYDLEGA CYQNDGLLHS SLTEGRFYKQ 101: RLPSSSPHFS QGESFVLEVI SEPSDNALVG QTLKLPAEKG SLAEVQTYDW QNNRNENLQY NLEKDRLINL SPRLVEDQRS WLFLEVIAGP AIGLQHAVNS 201: TSSSKLPVKL GRVSPSDLAL KDSEVSGKHA QITWNSTKFK WELVDMGSLN GTLVNSHSIS HPDLGSRKWG NPVELASDDI ITLGTTTKVY VRISSQNEFQ 301: IPFKIGVASD PMAMRRGGRK LPMEDVCHYK WPLPGANKFG LFCVCDGHGG SGAAQSAIKI IPEVLANILS DSLRKEKVLS KRDASDVLRD MFAKTEARLE 401: EHQYEGCTAT VLLVWKDNEE NFFAQCANLG DSACVIHLGG RYIQMTEDHR VVSLSERKRF QEAGLALRDG ETRLFGINLA RMLGDKFPKQ QDSRFSAEPY 501: ISEPLRIDQS SKDVFAVLAS DGLWDVVSPK KAVQLVLQMR DKERGRESSA EKIANGLLNE ARAMRTKDNT SIIYLDFDTS L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)