AT4G39400.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a plasma membrane localized leucine-rich repeat receptor kinase involved in brassinosteroid signal transduction. BRI1 ligand is brassinolide which binds at the extracellular domain. Binding results in phosphorylation of the kinase domain which activates the BRI1 protein leading to BR responses. Residue T-1049 and either S-1044 or T-1045 were essential for kinase function in vitro and normal BRI1 signaling in planta. Although BAK1 and BRI1 alone localize in the plasma membrane, when BAK1 and BRI1 are coexpressed, the heterodimer BAK1/BRI1 they form is localized in the endosome. BRI1 appears to be involved in the autonomous pathway that regulates the transition to flowering, primarily through its effects on FLC expression levels, as uncovered by double mutant analyses. This most likely occurs as a result of BRI1-dependent effects on histone acetylation, but not histone triMeH3K4 methylation, at the FLC locus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1 (BRI1); FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: in 9 processes; LOCATED IN: endosome, plasma membrane, protein complex; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: BRI1 like (TAIR:AT1G55610.2); Has 214988 Blast hits to 139206 proteins in 4645 species: Archae - 193; Bacteria - 21464; Metazoa - 65624; Fungi - 10774; Plants - 90532; Viruses - 410; Other Eukaryotes - 25991 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:18324826..18328416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 130551.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1196 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MKTFSSFFLS VTTLFFFSFF SLSFQASPSQ SLYREIHQLI SFKDVLPDKN LLPDWSSNKN PCTFDGVTCR DDKVTSIDLS SKPLNVGFSA VSSSLLSLTG 0101: LESLFLSNSH INGSVSGFKC SASLTSLDLS RNSLSGPVTT LTSLGSCSGL KFLNVSSNTL DFPGKVSGGL KLNSLEVLDL SANSISGANV VGWVLSDGCG 0201: ELKHLAISGN KISGDVDVSR CVNLEFLDVS SNNFSTGIPF LGDCSALQHL DISGNKLSGD FSRAISTCTE LKLLNISSNQ FVGPIPPLPL KSLQYLSLAE 0301: NKFTGEIPDF LSGACDTLTG LDLSGNHFYG AVPPFFGSCS LLESLALSSN NFSGELPMDT LLKMRGLKVL DLSFNEFSGE LPESLTNLSA SLLTLDLSSN 0401: NFSGPILPNL CQNPKNTLQE LYLQNNGFTG KIPPTLSNCS ELVSLHLSFN YLSGTIPSSL GSLSKLRDLK LWLNMLEGEI PQELMYVKTL ETLILDFNDL 0501: TGEIPSGLSN CTNLNWISLS NNRLTGEIPK WIGRLENLAI LKLSNNSFSG NIPAELGDCR SLIWLDLNTN LFNGTIPAAM FKQSGKIAAN FIAGKRYVYI 0601: KNDGMKKECH GAGNLLEFQG IRSEQLNRLS TRNPCNITSR VYGGHTSPTF DNNGSMMFLD MSYNMLSGYI PKEIGSMPYL FILNLGHNDI SGSIPDEVGD 0701: LRGLNILDLS SNKLDGRIPQ AMSALTMLTE IDLSNNNLSG PIPEMGQFET FPPAKFLNNP GLCGYPLPRC DPSNADGYAH HQRSHGRRPA SLAGSVAMGL 0801: LFSFVCIFGL ILVGREMRKR RRKKEAELEM YAEGHGNSGD RTANNTNWKL TGVKEALSIN LAAFEKPLRK LTFADLLQAT NGFHNDSLIG SGGFGDVYKA 0901: ILKDGSAVAI KKLIHVSGQG DREFMAEMET IGKIKHRNLV PLLGYCKVGD ERLLVYEFMK YGSLEDVLHD PKKAGVKLNW STRRKIAIGS ARGLAFLHHN 1001: CSPHIIHRDM KSSNVLLDEN LEARVSDFGM ARLMSAMDTH LSVSTLAGTP GYVPPEYYQS FRCSTKGDVY SYGVVLLELL TGKRPTDSPD FGDNNLVGWV 1101: KQHAKLRISD VFDPELMKED PALEIELLQH LKVAVACLDD RAWRRPTMVQ VMAMFKEIQA GSGIDSQSTI RSIEDGGFST IEMVDMSIKE VPEGKL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)