AT5G02490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Heat shock protein 70 (Hsp 70) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Heat shock protein 70 (Hsp 70) family protein; FUNCTIONS IN: protein binding; INVOLVED IN: protein folding, response to cadmium ion, response to heat, response to bacterium; LOCATED IN: cytosol, cell wall, plasma membrane; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Heat shock protein 70, conserved site (InterPro:IPR018181), Heat shock protein Hsp70 (InterPro:IPR001023), Heat shock protein 70 (InterPro:IPR013126); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: heat shock cognate protein 70-1 (TAIR:AT5G02500.1); Has 34231 Blast hits to 33880 proteins in 4856 species: Archae - 163; Bacteria - 16495; Metazoa - 3845; Fungi - 1761; Plants - 1263; Viruses - 309; Other Eukaryotes - 10395 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:550296..552565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 71390.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 653 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGKGEGPAI GIDLGTTYSC VGVWQHDRVE IIANDQGNRT TPSYVAFTDS ERLIGDAAKN QVAMNPVNTV FDAKRLIGRR FSDASVQSDR QLWPFTIISG 101: TAEKPMIVVE YKGEEKQFAA EEISSMVLIK MREIAEAFLG TTVKNAVVTV PAYFNDSQRQ ATKDAGVIAG LNVLRIINEP TAAAIAYGLD KKATSVGEKN 201: VLIFDLGGGT FDVSLLTIEE GIFEVKATAG DTHLGGEDFD NRMVNHFVQE FKRKNKQDIT GQPRALRRLR TACERAKRTL SSTAQTTIEI DSLYGGADFY 301: SPITRARFEE MNMDLFRKCM EPVEKCLRDA KMDKSTVHEI VLVGGSTRIP KVQQLLQDFF NGKELCKSIN PDEAVAYGAA VQAAILSGEG NEKVQDLLLL 401: DVTPLSLGLE TAGGVMTTLI QRNTTIPTKK EQVFSTYSDN QPGVLIQVFE GERARTKDNN LLGKFELSGI PPAPRGVPQI TVCFDIDANG ILNVSAEDKT 501: TGKKNKITIT NDKGRLSKED IEKMVQEAEK YKSEDEEHKK KVEAKNALEN YAYNMRNTIR DEKIGEKLPA ADKKKVEDSI EEAIQWLDGN QLGEADEFED 601: KMKELESVCN PIIAKMYQGG AGGEAGGPGA SGMDEDEAPP ASGGAGPKIE EVD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)