AT1G21250.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cell wall-associated kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
cell wall-associated kinase, may function as a signaling receptor of extracellular matrix component such as oligogalacturonides. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cell wall-associated kinase (WAK1); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: cell surface receptor linked signaling pathway, response to virus, defense response to fungus, response to salicylic acid stimulus; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole, plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: EGF-like calcium-binding (InterPro:IPR001881), EGF-like, type 3 (InterPro:IPR000742), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EGF-like calcium-binding, conserved site (InterPro:IPR018097), EGF-type aspartate/asparagine hydroxylation site (InterPro:IPR000152), EGF calcium-binding (InterPro:IPR013091), EGF-like (InterPro:IPR006210); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: wall associated kinase 3 (TAIR:AT1G21240.1); Has 130372 Blast hits to 120319 proteins in 4569 species: Archae - 123; Bacteria - 13482; Metazoa - 56283; Fungi - 9380; Plants - 33196; Viruses - 438; Other Eukaryotes - 17470 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:7439512..7441892 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 81215.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 735 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKVQEGLFLV AIFFSLACTQ LVKGQHQPGE NCQNKCGNIT IEYPFGISSG CYYPGNESFS ITCKEDRPHV LSDIEVANFN HSGQLQVLLN RSSTCYDEQG 101: KKTEEDSSFT LENLSLSANN KLTAVGCNAL SLLDTFGMQN YSTACLSLCD SPPEADGECN GRGCCRVDVS APLDSYTFET TSGRIKHMTS FHDFSPCTYA 201: FLVEDDKFNF SSTEDLLNLR NVMRFPVLLD WSVGNQTCEQ VGSTSICGGN STCLDSTPRN GYICRCNEGF DGNPYLSAGC QDVNECTTSS TIHRHNCSDP 301: KTCRNKVGGF YCKCQSGYRL DTTTMSCKRK EFAWTTILLV TTIGFLVILL GVACIQQRMK HLKDTKLREQ FFEQNGGGML TQRLSGAGPS NVDVKIFTED 401: GMKKATNGYA ESRILGQGGQ GTVYKGILPD NSIVAIKKAR LGDSSQVEQF INEVLVLSQI NHRNVVKLLG CCLETEVPLL VYEFITNGTL FDHLHGSMID 501: SSLTWEHRLK IAIEVAGTLA YLHSSASIPI IHRDIKTANI LLDVNLTAKV ADFGASRLIP MDKEELETMV QGTLGYLDPE YYNTGLLNEK SDVYSFGVVL 601: MELLSGQKAL CFKRPQSSKH LVSYFATATK ENRLDEIIGG EVMNEDNLKE IQEAARIAAE CTRLMGEERP RMKEVAAKLE ALRVEKTKHK WSDQYPEENE 701: HLIGGHILSA QGETSSSIGY DSIKNVAILD IETGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)