AT1G21270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : wall-associated kinase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
cytoplasmic serine/threonine protein kinase induced by salicylic acid. mutant plants exhibit a loss of cell expansion and dependence on sugars and salts for seedling growth, affecting the expression and activity of vacuolar invertase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
wall-associated kinase 2 (WAK2); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, calcium ion binding, ATP binding; INVOLVED IN: cellular water homeostasis, protein amino acid phosphorylation, oligosaccharide metabolic process, unidimensional cell growth, response to salicylic acid stimulus; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 18 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: EGF-like calcium-binding (InterPro:IPR001881), EGF-like, type 3 (InterPro:IPR000742), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), EGF-like region, conserved site (InterPro:IPR013032), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EGF-like calcium-binding, conserved site (InterPro:IPR018097), EGF-type aspartate/asparagine hydroxylation site (InterPro:IPR000152), EGF calcium-binding (InterPro:IPR013091), EGF-like (InterPro:IPR006210); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: wall associated kinase 5 (TAIR:AT1G21230.1); Has 140654 Blast hits to 123720 proteins in 4781 species: Archae - 129; Bacteria - 13911; Metazoa - 65181; Fungi - 9585; Plants - 33448; Viruses - 437; Other Eukaryotes - 17963 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:7444997..7447345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 81648.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 732 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKVQEGLFVV AVFYLAYTQL VKGQPRKECQ TRCGNVAVEY PFGTSPGCYY PGDESFNLTC NEQEKLFFGN MPVINMSLSG QLRVRLVRSR VCYDSQGKQT 101: DYIAQRTTLG NFTLSELNRF TVVGCNSYAF LRTSGVEKYS TGCISICDSA TTKNGSCSGE GCCQIPVPRG YSFVRVKPHS FHNHPTVHLF NPCTYAFLVE 201: DGMFDFHALE DLNNLRNVTT FPVVLDWSIG DKTCKQVEYR GVCGGNSTCF DSTGGTGYNC KCLEGFEGNP YLPNGCQDIN ECISSRHNCS EHSTCENTKG 301: SFNCNCPSGY RKDSLNSCTR KVRPEYFRWT QIFLGTTIGF SVIMLGISCL QQKIKHRKNT ELRQKFFEQN GGGMLIQRVS GAGPSNVDVK IFTEKGMKEA 401: TNGYHESRIL GQGGQGTVYK GILPDNSIVA IKKARLGNRS QVEQFINEVL VLSQINHRNV VKVLGCCLET EVPLLVYEFI NSGTLFDHLH GSLYDSSLTW 501: EHRLRIATEV AGSLAYLHSS ASIPIIHRDI KTANILLDKN LTAKVADFGA SRLIPMDKEQ LTTIVQGTLG YLDPEYYNTG LLNEKSDVYS FGVVLMELLS 601: GQKALCFERP HCPKNLVSCF ASATKNNRFH EIIDGQVMNE DNQREIQEAA RIAAECTRLM GEERPRMKEV AAELEALRVK TTKYKWSDQY RETGEIEHLL 701: GVQILSAQGE TSSSIGYDSI RNVTTLDIEA GR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)