AT3G56400.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WRKY DNA-binding protein 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of WRKY Transcription Factor; Group III. Function as activator of SA-dependent defense genes and a repressor of JA-regulated genes. WRKY70-controlled suppression of JA-signaling is partly executed by NPR1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
WRKY DNA-binding protein 70 (WRKY70); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding WRKY (InterPro:IPR003657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: WRKY DNA-binding protein 54 (TAIR:AT2G40750.1); Has 3203 Blast hits to 2772 proteins in 182 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 3190; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 13 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:20909082..20910409 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32937.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 294 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDTNKAKKLK VMNQLVEGHD LTTQLQQLLS QPGSGLEDLV AKILVCFNNT ISVLDTFEPI SSSSSLAAVE GSQNASCDND GKFEDSGDSR KRLGPVKGKR 101: GCYKRKKRSE TCTIESTILE DAFSWRKYGQ KEILNAKFPR SYFRCTHKYT QGCKATKQVQ KVELEPKMFS ITYIGNHTCN TNAETPKSKT CDHHDEIFMD 201: SEDHKSPSLS TSMKEEDNPH RHHGSSTEND LSLVWPEMVF EEDYHHQASY VNGKTSTSID VLGSQDLMVF GGGGDFEFSE NEHFSIFSSC SNLS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)