AT5G35790.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glucose-6-phosphate dehydrogenase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a plastidic glucose-6-phosphate dehydrogenase that is sensitive to reduction by DTT and whose mRNA is more prevalent in developing organs but absent in the root. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glucose-6-phosphate dehydrogenase 1 (G6PD1); FUNCTIONS IN: glucose-6-phosphate dehydrogenase activity, protein binding; INVOLVED IN: pentose-phosphate shunt, oxidative branch, glucose metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glucose-6-phosphate dehydrogenase, C-terminal (InterPro:IPR022675), Glucose-6-phosphate dehydrogenase, active site (InterPro:IPR019796), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Glucose-6-phosphate dehydrogenase (InterPro:IPR001282), Glucose-6-phosphate dehydrogenase, NAD-binding (InterPro:IPR022674); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glucose-6-phosphate dehydrogenase 2 (TAIR:AT5G13110.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:13956879..13959686 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 65431.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 576 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATHSMIIPS PSSSSSSLAT AASPFKETLP LFSRSLTFPR KSLFSQVRLR FFAEKHSQLD TSNGCATNFA SLQDSGDQLT EEHVTKGEST LSITVVGASG 101: DLAKKKIFPA LFALFYEGCL PQDFSVFGYA RTKLTHEELR DMISSTLTCR IDQREKCGDK MEQFLKRCFY HSGQYNSEED FAELNKKLKE KEAGKISNRL 201: YYLSIPPNIF VDVVRCASLR ASSENGWTRV IVEKPFGRDS ESSGELTRCL KQYLTEEQIF RIDHYLGKEL VENLSVLRFS NLVFEPLWSR NYIRNVQLIF 301: SEDFGTEGRG GYFDQYGIIR DIMQNHLLQI LALFAMETPV SLDAEDIRSE KVKVLRSMKP LRLEDVVVGQ YKGHNKGGKT YPGYTDDPTV PNHSLTPTFA 401: AAAMFINNAR WDGVPFLMKA GKALHTRGAE IRVQFRHVPG NLYKKSFATN LDNATNELVI RVQPDEGIYL RINNKVPGLG MRLDRSDLNL LYRSRYPREI 501: PDAYERLLLD AIEGERRLFI RSDELDAAWD LFTPALKELE EKKIIPELYP YGSRGPVGAH YLASKYNVRW GDLGEA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)