AT3G57260.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : beta-1,3-glucanase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
beta 1,3-glucanase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
beta-1,3-glucanase 2 (BGL2); FUNCTIONS IN: glucan 1,3-beta-glucosidase activity, protein binding, cellulase activity, hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds; INVOLVED IN: systemic acquired resistance, response to cold; LOCATED IN: apoplast, cell wall, vacuole; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycoside hydrolase, catalytic core (InterPro:IPR017853), Glycoside hydrolase, family 17 (InterPro:IPR000490), Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core (InterPro:IPR013781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: beta-1,3-glucanase 3 (TAIR:AT3G57240.1); Has 2232 Blast hits to 2218 proteins in 176 species: Archae - 0; Bacteria - 18; Metazoa - 3; Fungi - 79; Plants - 2105; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 27 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:21188709..21189822 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37340.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 339 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSESRSLASP PMLMILLSLV IASFFNHTAG QIGVCYGMLG DTLPSPSDVV ALYKQQNIQR MRLYGPDPGA LAALRGSDIE LILDVPSSDL ERLASSQTEA 101: DKWVQENVQS YRDGVRFRYI NVGNEVKPSV GGFLLQAMQN IENAVSGAGL EVKVSTAIAT DTTTDTSPPS QGRFRDEYKS FLEPVIGFLA SKQSPLLVNL 201: YPYFSYMGDT ANIHLDYALF TAQSTVDNDP GYSYQNLFDA NLDSVYAALE KSGGGSLEIV VSETGWPTEG AVGTSVENAK TYVNNLIQHV KNGSPRRPGK 301: AIETYIFAMF DENKKEPTYE KFWGLFHPDR QSKYEVNFN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)