AT5G26860.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (mitochondrial marker)
Arabidopsis cell culture (plastidal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : lon protease 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the Lon protease-like proteins (Lon1/At5g26860, Lon2/At5g47040, Lon3/At3g05780, Lon4/At3g05790). Lon is a multifunctional ATP-dependent protease which exists in bacteria, archaea and within organelles in eukaryotic cells. Lon proteases are responsible for the degradation of abnormal, damaged and unstable proteins. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
lon protease 1 (LON1); FUNCTIONS IN: serine-type peptidase activity, protein binding, ATP-dependent peptidase activity, ATP binding; INVOLVED IN: proteolysis; LOCATED IN: cytosol, mitochondrion; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, AAA-type, core (InterPro:IPR003959), Peptidase S16, active site (InterPro:IPR008268), Peptidase S16, ATP-dependent protease La (InterPro:IPR004815), Peptidase S16, lon N-terminal (InterPro:IPR003111), Peptidase S16, Lon C-terminal (InterPro:IPR008269), ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold (InterPro:IPR020568), Peptidase S16, Lon protease, C-terminal (InterPro:IPR001984); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: lon protease 4 (TAIR:AT3G05790.1); Has 18238 Blast hits to 18056 proteins in 2534 species: Archae - 547; Bacteria - 9804; Metazoa - 746; Fungi - 600; Plants - 445; Viruses - 7; Other Eukaryotes - 6089 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:9451183..9456631 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 103936.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 940 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLKLFTSSAS RVHHLTPVSR VVGSSPVESP LFKALSQITG WNRRSTSLGH RAFFCSEPTN GEAAAEAETK AVESDSEVSD SKSSSAIVPT NPRPEDCLTV 101: LALPVPHRPL FPGFYMPIYV KDPKVLAALQ ESRRRQAPYA GAFLLKDDPS ADSSSSTDAE KNINELKGKE LLNRLHEVGT LAQISSIQGD QVILVGHRRL 201: RIKEMVSEEP LTVKVDHLKD NPFDMDDDVV KATSFEVIST LRDVLKTSSL WRDHVQTYTQ HIGDFTYPRL ADFGAAICGA NRHQAQEVLE ELDVHKRLRL 301: TLELMKKEME ISKIQETIAK AIEEKISGEQ RRYLLNEQLK AIKKELGVET DDKSALSAKF KERIEPNKEK IPAHVLQVIE EELTKLQLLE ASSSEFNVTR 401: NYLDWLTILP WGNYSNENFD VARAQTILDE DHYGLSDVKE RILEFIAVGR LRGTSQGKII CLSGPPGVGK TSIGRSIARA LNRKFFRFSV GGLADVAEIK 501: GHRRTYVGAM PGKMVQCLKS VGTANPLVLI DEIDKLGRGH AGDPASALLE LLDPEQNANF LDHYLDVTID LSKVLFVCTA NVIDMIPNPL LDRMEVISIA 601: GYITDEKVHI ARDYLEKTAR GDCGVKPEQV EVSDAALLSL IENYCREAGV RNLQKQIEKI YRKIALKLVR EGAVPEEPAV ASDPEEAEIV ADVGESIENH 701: TVEENTVSSA EEPKEEAQTE KIAIETVMID ESNLADYVGK PVFHAEKLYE QTPVGVVMGL AWTSMGGSTL YIETTVVEEG EGKGGLNITG QLGDVMKESA 801: QIAHTVARKI MLEKEPENQF FANSKLHLHV PAGATPKDGP SAGCTMITSL LSLATKKPVR KDLAMTGEVT LTGRILPIGG VKEKTIAARR SQIKTIIFPE 901: ANRRDFDELA ENVKEGLNVH FVDDYGKIFE LAFGYDKQED |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)