AT4G23150.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.999 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 7 (CRK7); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 11 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 (TAIR:AT4G23160.1); Has 123287 Blast hits to 121744 proteins in 4655 species: Archae - 106; Bacteria - 14344; Metazoa - 45046; Fungi - 10671; Plants - 34613; Viruses - 423; Other Eukaryotes - 18084 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:12125731..12128301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 73929.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 659 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSLFPFIFL FLFSFLTSFR ASAQDPRFLA YYCPNATTYS SNSTYLTNLK TLLSSLSSRN ASYSTGFQNA TVGQALDRVT GLFLCRGDVS PEVCRNCVTF 101: AVNNTFSRCP NQREAVFYYE ECILRYSHKN ILSTAITNEG EFILRNPNHI SPIQNQINQF TNLVLSNMNQ IAIEAADNPR KFSTIKTELT ALQTFYGLVQ 201: CTPDLSRQNC MNCLTSSINR MPFSRIGARQ FWPSCNSRYE LYDFYNETAI GTPPPPLPPL ASPSLSDKSG NSNVVVVAVV VPIIVAVLIF IAGYCFFAKR 301: AKKTYGTTPA LDEDDKTTIE SLQLDYRAIQ AATNDFSENN KIGRGGFGDV YKGTFSNGTE VAVKRLSKTS EQGDTEFKNE VVVVANLRHK NLVRILGFSI 401: EREERILVYE YVENKSLDNF LFDPAKKGQL YWTQRYHIIG GIARGILYLH QDSRLTIIHR DLKASNILLD ADMNPKIADF GMARIFGMDQ TQQNTSRIVG 501: TYGYMSPEYA MRGQFSMKSD VYSFGVLVLE IISGRKNNSF IETDDAQDLV THAWRLWRNG TALDLVDPFI ADSCRKSEVV RCTHIGLLCV QEDPVKRPAM 601: STISVMLTSN TMALPAPQQP GFFVRSRPGT NRLDSDQSTT NKSVTVSIDD KSMSDLDPR |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)