AT3G48890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : membrane-associated progesterone binding protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
putative progesterone-binding protein homolog (Atmp2) mRNA, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
membrane-associated progesterone binding protein 3 (MAPR3); FUNCTIONS IN: heme binding; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, nucleus; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome b5 (InterPro:IPR001199); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: membrane steroid binding protein 1 (TAIR:AT5G52240.1); Has 1079 Blast hits to 1069 proteins in 199 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 428; Fungi - 337; Plants - 203; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 109 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:18129669..18131353 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25383.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 233 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVQQIWETLK ETITAYTGLS PAAFFTVLAL AFAVYQVVSG FFVSPEVHRP RSLEVQPQSE PLPPPVQLGE ITEEELKLYD GSDSKKPLLM AIKGQIYDVS 101: QSRMFYGPGG PYALFAGKDA SRALAKMSFE DQDLTGDISG LGAFELEALQ DWEYKFMSKY VKVGTIQKKD GEGKESSEPS EAKTASAEGL STNTGEEASA 201: ITHDETSRST GEKIAETTEK KDVATDDDDA AKE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)