AT1G21240.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : wall associated kinase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a wall-associated kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
wall associated kinase 3 (WAK3); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 9 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: EGF-like calcium-binding (InterPro:IPR001881), EGF-like, type 3 (InterPro:IPR000742), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), EGF-type aspartate/asparagine hydroxylation site (InterPro:IPR000152), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EGF-like calcium-binding, conserved site (InterPro:IPR018097), EGF calcium-binding (InterPro:IPR013091), EGF-like (InterPro:IPR006210); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cell wall-associated kinase (TAIR:AT1G21250.1); Has 137245 Blast hits to 122966 proteins in 4824 species: Archae - 125; Bacteria - 13959; Metazoa - 61902; Fungi - 9553; Plants - 33418; Viruses - 443; Other Eukaryotes - 17845 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:7434303..7436702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 82705.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 741 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKFQEGVFLV VIFFLAYTQL VKGQHQPRED CKLKCGNVTI EYPFGISTGC YYPGDDNFNL TCVVEEKLLL FGIIQVTNIS HSGHVSVLFE RFSECYEQKN 101: ETNGTALGYQ LGSSFSLSSN NKFTLVGCNA LSLLSTFGKQ NYSTGCLSLC NSQPEANGRC NGVGCCTTED FSVPFDSDTF QFGSVRLRNQ VNNSLDLFNT 201: SVYQFNPCTY AFLVEDGKFN FDSSKDLKNL RNVTRFPVAL DWSIGNQTCE QAGSTRICGK NSSCYNSTTR NGYICKCNEG YDGNPYRSEG CKDIDECISD 301: THNCSDPKTC RNRDGGFDCK CPSGYDLNSS MSCTRPEYKR TRIFLVIIIG VLVLLLAAIC IQHATKQRKY TKLRRQFFEQ NGGGMLIQRL SGAGLSNIDF 401: KIFTEEGMKE ATNGYDESRI LGQGGQGTVY KGILPDNTIV AIKKARLADS RQVDQFIHEV LVLSQINHRN VVKILGCCLE TEVPLLVYEF ITNGTLFDHL 501: HGSIFDSSLT WEHRLRIAIE VAGTLAYLHS SASIPIIHRD IKTANILLDE NLTAKVADFG ASKLIPMDKE QLTTMVQGTL GYLDPEYYTT GLLNEKSDVY 601: SFGVVLMELL SGQKALCFER PQASKHLVSY FVSATEENRL HEIIDDQVLN EDNLKEIQEA ARIAAECTRL MGEERPRMKE VAAKLEALRV EKTKHKWSDQ 701: YPEENEHLIG GHILSAQGET SSSIGYDSIK NVAILDIETG R |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)