AT4G04500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 37 (CRK37); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 39 (TAIR:AT4G04540.1); Has 124275 Blast hits to 122767 proteins in 4611 species: Archae - 108; Bacteria - 13946; Metazoa - 45736; Fungi - 10814; Plants - 34713; Viruses - 456; Other Eukaryotes - 18502 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:2238411..2240767 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 73444.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 646 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKSCVVTSS FSLLLLFLQT LKYVHAGFIC YGDFFNVNYG VSRTYLFSSL PSNVVSNGGF YNASFGRDSK NNRVHVVALC RRGYEKQACK TCLEHVIEDT 101: KSKCPRQKES FSWVTDEFDD VSCSLRYTNH STLGKLELLP NTINPNPNSI DSKFNNMAMF SQEWIAMVNR TLEAASTAEN SSVLKYYSAT RTEFTQISDV 201: YALMQCVPDL SPGNCKRCLR ECVNDFQKQF WGRQGGGVSR PSCYFRWDLY PYYRAFDNVV RVPAPPPQAS STIIDYGRDE KSFQGSNIAI IVVPSVINLI 301: IFVVLIFSWK RKQSHTIIND VFDSNNGQSM LRFDLRMIVT ATNNFSLENK LGQGGFGSVY KGILPSGQEI AVKRLRKGSG QGGMEFKNEV LLLTRLQHRN 401: LVKLLGFCNE KDEEILVYEF VPNSSLDHFI FDEEKRRVLT WDVRYTIIEG VARGLLYLHE DSQLRIIHRD LKASNILLDA EMNPKVADFG MARLFDMDET 501: RGQTSRVVGT YGYMAPEYAT YGQFSTKSDV YSFGVMLLEM ISGKSNKKLE KEEEEEEEEL PAFVWKRWIE GRFAEIIDPL AAPSNNISIN EVMKLIHIGL 601: LCVQEDISKR PSINSILFWL ERHATITMPV PTPVAYLTRP SLSLGH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)