AT5G65430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : general regulatory factor 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of 14-3-3 proteins. This protein is reported to interact with the BZR1 transcription factor involved in brassinosteroid signaling and may affect the nucleocytoplasmic shuttling of BZR1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
general regulatory factor 8 (GRF8); FUNCTIONS IN: protein phosphorylated amino acid binding; INVOLVED IN: brassinosteroid mediated signaling pathway; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 14-3-3 protein (InterPro:IPR000308); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: G-box regulating factor 6 (TAIR:AT5G10450.1); Has 2678 Blast hits to 2669 proteins in 381 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1257; Fungi - 298; Plants - 764; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 359 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:26148546..26150255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28030.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 248 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATTLSRDQY VYMAKLAEQA ERYEEMVQFM EQLVSGATPA GELTVEERNL LSVAYKNVIG SLRAAWRIVS SIEQKEESRK NEEHVSLVKD YRSKVETELS 101: SICSGILRLL DSHLIPSATA SESKVFYLKM KGDYHRYLAE FKSGDERKTA AEDTMIAYKA AQDVAVADLA PTHPIRLGLA LNFSVFYYEI LNSSEKACSM 201: AKQAFEEAIA ELDTLGEESY KDSTLIMQLL RDNLTLWTSD MQEQMDEA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)