AT1G35160.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GF14 protein phi chain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
GF14 protein phi chain member of 14-3-3 protein family. This protein is reported to interact with the BZR1 transcription factor involved in brassinosteroid signaling and may affect the nucleocytoplasmic shuttling of BZR1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
GF14 protein phi chain (GF14 PHI); FUNCTIONS IN: protein phosphorylated amino acid binding; INVOLVED IN: brassinosteroid mediated signaling pathway; LOCATED IN: nuclear envelope, plasma membrane, cytoplasm; EXPRESSED IN: cotyledon, guard cell, cultured cell, leaf; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 14-3-3 protein (InterPro:IPR000308); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: general regulatory factor 2 (TAIR:AT1G78300.1); Has 2689 Blast hits to 2679 proteins in 386 species: Archae - 0; Bacteria - 6; Metazoa - 1256; Fungi - 306; Plants - 766; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 355 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:12867264..12868514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30195.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 267 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAPPASSSA REEFVYLAKL AEQAERYEEM VEFMEKVAEA VDKDELTVEE RNLLSVAYKN VIGARRASWR IISSIEQKEE SRGNDDHVTT IRDYRSKIES 101: ELSKICDGIL KLLDTRLVPA SANGDSKVFY LKMKGDYHRY LAEFKTGQER KDAAEHTLTA YKAAQDIANA ELAPTHPIRL GLALNFSVFY YEILNSPDRA 201: CNLAKQAFDE AIAELDTLGE ESYKDSTLIM QLLRDNLTLW TSDMQDESPE EIKEAAAPKP AEEQKEI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)