AT1G80080.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat (LRR) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a transmembrane leucine-repeat containing receptor-like protein that is expressed in proliferative postprotodermal cells. Recessive mutation leads to disruption of asymmetric cell division during stomata development. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
TOO MANY MOUTHS (TMM); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: receptor like protein 29 (TAIR:AT2G42800.1); Has 88991 Blast hits to 28047 proteins in 1079 species: Archae - 16; Bacteria - 3330; Metazoa - 23111; Fungi - 805; Plants - 56845; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4884 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:30128073..30129563 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54508.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 496 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARYEFFRQI FIVLSIVSPL VRSFTVITSD STAPSALIDG PQTGFTMTND GARTEPDEQD AVYDIMRATG NDWAAAIPDV CRGRWHGIEC MPDQDNVYHV 101: VSLSFGALSD DTAFPTCDPQ RSYVSESLTR LKHLKALFFY RCLGRAPQRI PAFLGRLGSS LQTLVLRENG FLGPIPDELG NLTNLKVLDL HKNHLNGSIP 201: LSFNRFSGLR SLDLSGNRLT GSIPGFVLPA LSVLDLNQNL LTGPVPPTLT SCGSLIKIDL SRNRVTGPIP ESINRLNQLV LLDLSYNRLS GPFPSSLQGL 301: NSLQALMLKG NTKFSTTIPE NAFKGLKNLM ILVLSNTNIQ GSIPKSLTRL NSLRVLHLEG NNLTGEIPLE FRDVKHLSEL RLNDNSLTGP VPFERDTVWR 401: MRRKLRLYNN AGLCVNRDSD LDDAFGSKSG STVRLCDAET SRPAPSGTVQ HLSREEDGAL PDGATDVSST SKSLGFSYLS AFFLVFPNFI FMLISS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)