AT2G07734.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Alpha-L RNA-binding motif/Ribosomal protein S4 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Alpha-L RNA-binding motif/Ribosomal protein S4 family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome, RNA binding; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: small ribosomal subunit; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: RNA-binding S4 (InterPro:IPR002942); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: mitochondrial ribosomal protein S4 (TAIR:ATMG00290.1); Has 1839 Blast hits to 1839 proteins in 823 species: Archae - 0; Bacteria - 683; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 800; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 356 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:3472604..3473692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43028.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 362 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MWLLKKLIQR DIDLSPLRFQ TCRLLSGNVR NRELTIIQRR ILRRLRNRKR SIKKRKIYPK KYLTSYIQLQ TTRKLPLFHG DLPITEMHRG TKRTSYIPFP 101: LNPETRFDVI PLRLHFLETI PQARQPISHR RVCVNKGMVS ITHFKLSHGD IISFQENNAI IRGEEIRRSF YKEISVEKII GKLLHQPLRM WRRSKTEWFH 201: LLKTKRGCRL LLKSRFLQQL RSSMQEEDLE RTKKFGSEKV CLGSSFAEHK RMKRNLLKSL FLSKRRKDKN LNLPTRTISP IVYNSSLSLY SNSTYCFASP 301: HKLTMKRRIK RIELPTHYSE VNHRTPKAVV SYGPNIGHIP HDIRLKDPNL PLRSRNGRGQ NI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)