AT2G07696.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein S7p/S5e family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein S7p/S5e family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: ribosome, small ribosomal subunit, intracellular; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S7, bacterial-type (InterPro:IPR005717), Ribosomal protein S7 (InterPro:IPR000235); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: mitochondrial ribosomal protein S7 (TAIR:ATMG01270.1); Has 8961 Blast hits to 8961 proteins in 3118 species: Archae - 58; Bacteria - 5463; Metazoa - 117; Fungi - 32; Plants - 1193; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2098 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:3351340..3351786 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17202.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 148 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGGLDGEQKL LIKKLVNFRM KEGKRTRVRA IVYQTFHRPA RTERDVIKLM VDAVENIKPI CEVAKVGVAG TIYDVPGIVA RDRQQTLAIR WILEAAFKRR 101: ISYRISLEKC SFAEILDAYQ KRGSARRKRE NLHGLASTNR SFAHFRWW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)