AT2G07671.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP synthase subunit C family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ATP synthase subunit C family protein; FUNCTIONS IN: hydrogen ion transmembrane transporter activity, ATPase activity; INVOLVED IN: proton transport, ATP synthesis coupled proton transport; LOCATED IN: proton-transporting ATP synthase complex, coupling factor F(o), proton-transporting two-sector ATPase complex, proton-transporting domain; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, F0 complex, subunit C, DCCD-binding site (InterPro:IPR020537), ATPase, F0/V0 complex, subunit C (InterPro:IPR002379), ATPase, F0 complex, subunit C (InterPro:IPR000454); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: mitochondrial F0-ATPase subunit 9 (TAIR:ATMG01080.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:3251856..3252113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 8841.88 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 85 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MTKREYNSQP EMLEGAKSIG AGAATIASAG AAIGIGNVFS SLIHSVARNP SLAKQSFGYA ILGFALTEAI ALFAPMMAFL ILFVF | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)