AT2G07741.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATPase, F0 complex, subunit A protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ATPase, F0 complex, subunit A protein; FUNCTIONS IN: hydrogen ion transmembrane transporter activity, hydrogen ion transporting ATP synthase activity, rotational mechanism; INVOLVED IN: proton transport, ATP synthesis coupled proton transport; LOCATED IN: proton-transporting ATP synthase complex, coupling factor F(o), membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, F0 complex, subunit A (InterPro:IPR000568); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATPase subunit 6-1 (TAIR:ATMG00410.1); Has 33502 Blast hits to 33498 proteins in 7990 species: Archae - 5; Bacteria - 5045; Metazoa - 23836; Fungi - 1157; Plants - 873; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2586 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:3502319..3503476 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42354.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 385 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRRIFLFDEN SLNSSSTIDT SSASTIDTSF ASQCTNFSSG QASGTQDTHA GIFEDCPGLN PNDERVVELQ CEIREKCEAL TQDPEMGLIL GEALHAESDN 101: VPFLQSIADD LTQNGVSGEA FQEALNIVGQ AAASPLDQFE IVPLIPMHIG NFYFSFTNPS LFMLLTLSFF LLLIHFVTKK GGGNLVPNAW QSLVELLYDF 201: VLNLVKEQIG GLSGNVKQMF FPCILVTFLF LLFCNLQGMI PYSFTVTSHF LITLALSFSI FIGITIVGFQ RHGLHFFSFL LPAGVPLPLA PFLVLLELIS 301: YCFRALSLGI RLFANMMAGH SLVKILSGFA WTMLCMNDIF YFIGALGPLF IVLALTGLEL GVAILQAYVF TILICIYLND AINLH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)