AT1G32900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-Glycosyltransferase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein binding, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: biosynthetic process, glucan biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycogen/starch synthases, ADP-glucose type (InterPro:IPR011835), Starch synthase, catalytic domain (InterPro:IPR013534), Glycosyl transferase, group 1 (InterPro:IPR001296); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: starch synthase 2 (TAIR:AT3G01180.1); Has 13950 Blast hits to 13932 proteins in 3602 species: Archae - 351; Bacteria - 6813; Metazoa - 7; Fungi - 173; Plants - 5477; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1129 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:11920582..11923506 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 66883.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 610 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATVTASSNF VSRTSLFNNH GASSCSDVAQ ITLKGQSLTH CGLRSFNMVD NLQRRSQAKP VSAKSSKRSS KVKTAGKIVC EKGMSVIFIG AEVGPWSKTG 101: GLGDVLGGLP PALAARGHRV MTICPRYDQY KDAWDTCVVV QIKVGDKVEN VRFFHCYKRG VDRVFVDHPI FLAKVVGKTG SKIYGPITGV DYNDNQLRFS 201: LLCQAALEAP QVLNLNSSKY FSGPYGEDVV FVANDWHTAL LPCYLKSMYQ SRGVYMNAKV VFCIHNIAYQ GRFAFDDYSL LNLPISFKSS FDFMDGYEKP 301: VKGRKINWMK AAILEAHRVL TVSPYYAQEL ISGVDRGVEL HKYLRMKTVS GIINGMDVQE WNPSTDKYID IKYDITTVTD AKPLIKEALQ AAVGLPVDRD 401: VPVIGFIGRL EEQKGSDILV EAISKFMGLN VQMVILGTGK KKMEAQILEL EEKFPGKAVG VAKFNVPLAH MITAGADFII VPSRFEPCGL IQLHAMRYGT 501: VPIVASTGGL VDTVKDGYTG FHIGRFNVKC EVVDPDDVIA TAKAVTRAVA VYGTSAMQEM VKNCMDQDFS WKGPARLWEK VLLSLNVAGS EAGTEGEEIA 601: PLAKENVATP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)