AT1G04110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Subtilase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Initially identified as a mutation affecting stomatal development and distribution. Encodes a protein similar to serine proteases. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
STOMATAL DENSITY AND DISTRIBUTION (SDD1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protease-associated PA (InterPro:IPR003137), Proteinase inhibitor, propeptide (InterPro:IPR009020), Peptidase S8/S53, subtilisin/kexin/sedolisin (InterPro:IPR000209), Peptidase S8, subtilisin-related (InterPro:IPR015500), Peptidase S8/S53, subtilisin, active site (InterPro:IPR022398), Proteinase inhibitor I9, subtilisin propeptide (InterPro:IPR010259); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Subtilase family protein (TAIR:AT2G05920.1); Has 8825 Blast hits to 7601 proteins in 1230 species: Archae - 300; Bacteria - 5187; Metazoa - 188; Fungi - 495; Plants - 1932; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 723 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:1061457..1063784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 83780.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 775 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEPKPFFLCI IFLLFCSSSS EILQKQTYIV QLHPNSETAK TFASKFDWHL SFLQEAVLGV EEEEEEPSSR LLYSYGSAIE GFAAQLTESE AEILRYSPEV 101: VAVRPDHVLQ VQTTYSYKFL GLDGFGNSGV WSKSRFGQGT IIGVLDTGVW PESPSFDDTG MPSIPRKWKG ICQEGESFSS SSCNRKLIGA RFFIRGHRVA 201: NSPEESPNMP REYISARDST GHGTHTASTV GGSSVSMANV LGNGAGVARG MAPGAHIAVY KVCWFNGCYS SDILAAIDVA IQDKVDVLSL SLGGFPIPLY 301: DDTIAIGTFR AMERGISVIC AAGNNGPIES SVANTAPWVS TIGAGTLDRR FPAVVRLANG KLLYGESLYP GKGIKNAGRE VEVIYVTGGD KGSEFCLRGS 401: LPREEIRGKM VICDRGVNGR SEKGEAVKEA GGVAMILANT EINQEEDSID VHLLPATLIG YTESVLLKAY VNATVKPKAR IIFGGTVIGR SRAPEVAQFS 501: ARGPSLANPS ILKPDMIAPG VNIIAAWPQN LGPTGLPYDS RRVNFTVMSG TSMSCPHVSG ITALIRSAYP NWSPAAIKSA LMTTADLYDR QGKAIKDGNK 601: PAGVFAIGAG HVNPQKAINP GLVYNIQPVD YITYLCTLGF TRSDILAITH KNVSCNGILR KNPGFSLNYP SIAVIFKRGK TTEMITRRVT NVGSPNSIYS 701: VNVKAPEGIK VIVNPKRLVF KHVDQTLSYR VWFVLKKKNR GGKVASFAQG QLTWVNSHNL MQRVRSPISV TLKTN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)