AT3G26830.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytochrome P450 superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Mutations in pad3 are defective in biosynthesis of the indole derived phytoalexin camalexin. Encodes a cytochrome P450 enzyme that catalyzes the conversion of dihydrocamalexic acid to camalexin. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PHYTOALEXIN DEFICIENT 3 (PAD3); FUNCTIONS IN: dihydrocamalexic acid decarboxylase activity, monooxygenase activity, oxygen binding; INVOLVED IN: in 6 processes; LOCATED IN: endoplasmic reticulum, microsome; EXPRESSED IN: 15 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 28 (TAIR:AT1G13090.1); Has 31909 Blast hits to 31706 proteins in 1646 species: Archae - 46; Bacteria - 3053; Metazoa - 11727; Fungi - 6529; Plants - 9477; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1077 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:9887990..9889560 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56064.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 490 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSVFLCFLVL LPLILIFLNV LKPSKYKLPP GPKKLPIIGN LHQRRTLHPR NRRNLAEMYG PVALLQYGFV PVVAISSKEA AEEVLKINDL ECCSRPEAAG 101: MRATFYNFKD IGMAPFGDEW SLMRKLSVVE LFSVKKLQSF KYIIEEENNL CVKKLSEFAT RQSPVNLERA IFTLVGNIVC RIGYGINLYE CDFFEADRVV 201: DLVLKAEAVI RETVFSDFFP GRIGRFIDCI SGQNRRLKNN FSVVDTFFQN VLNEHLKPGR ESSTIVDLMI DMKKKQENDG DALKFTTDHL KGMISDIFVA 301: GIGGVAGITL WGMTELIRNP RVMKKVQDEI RTTLGDKKER IKEEDLNQLH YFKLVVKETL RLHPTTPLLL PRQTMSHIKI QGYDVPAKTQ ILVNVYAMGR 401: DPKLWENADE FNPDRFLDSS VDFKGKNYEF IPFGSGRRIC PGMTMGTILV EMALLNLLYF FDWGLAKQEE AKEIINGEEN FLAFFQVLHH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)