AT3G48850.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphate transporter 3;2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
phosphate transporter 3;2 (PHT3;2); FUNCTIONS IN: binding; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: mitochondrial inner membrane, chloroplast, membrane; EXPRESSED IN: stem, sepal, stamen; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphate transporter 3;1 (TAIR:AT5G14040.1); Has 16855 Blast hits to 11571 proteins in 428 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 7278; Fungi - 4810; Plants - 3237; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1530 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:18114759..18116420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39026.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 363 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSDSSRSLIP SFLYSSDHRL FQATTMSTHL KSQPLISPTN SSVSSNGTSF AIATPNEKVE MYSPAYFAAC TVAGMLSCGI THTAITPLDV IKCNMQIDPL 101: KYKNITSAFK TTIKEQGLKG FTRGWSPTLL GYSAQGAFKY GLYEYAKKYY SDIVGPEYAA KYKTLIYLAG SASAEIVADV ALCPMEAVKV RVQTQPGFAR 201: GLSDGLPKII KSEGFRGLHK GLVPLWGRQI PYTMMKFATF ENTVELIYKK VMPTPKEECS KPVQLGVSFA GGYIAGIFCA IISHPADNLV SFLNNSKGAT 301: VADAVKRLGL WGMLTRGLPL RIFMIGTLTG AQWVIYDAVK VLAGLPTTGG ASPATALAPS VSA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)