AT1G77760.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 endoplasmic reticulum 0.000 ASURE: cytosol,nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nitrate reductase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes the cytosolic minor isoform of nitrate reductase (NR). Involved in the first step of nitrate assimilation, it contributes about 15% of the nitrate reductase activity in shoots. Similar to molybdopterin oxidoreductases at the N-terminus, and to FAD/NAD-binding cytochrome reductases at the C-terminus. Cofactors: FAD, heme iron (cytochrome B-557), and molybdenum-pterin. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
nitrate reductase 1 (NIA1); FUNCTIONS IN: nitrate reductase activity, protein binding; INVOLVED IN: nitric oxide biosynthetic process, nitrate assimilation, response to light stimulus; LOCATED IN: cytosol; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome b5, heme-binding site (InterPro:IPR018506), Nitrate reductase NADH dependent (InterPro:IPR012137), Ferredoxin reductase-type FAD-binding domain (InterPro:IPR017927), Oxidoreductase, FAD-binding domain (InterPro:IPR008333), Immunoglobulin E-set (InterPro:IPR014756), Cytochrome b5 (InterPro:IPR001199), NADH:cytochrome b5 reductase (CBR) (InterPro:IPR001834), Oxidoreductase, molybdopterin-binding domain (InterPro:IPR000572), Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding (InterPro:IPR001433), Oxidoreductase, molybdopterin binding site (InterPro:IPR022407), Riboflavin synthase-like beta-barrel (InterPro:IPR017938), Eukaryotic molybdopterin oxidoreductase (InterPro:IPR008335), Flavoprotein pyridine nucleotide cytochrome reductase (InterPro:IPR001709), Moybdenum cofactor oxidoreductase, dimerisation (InterPro:IPR005066); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nitrate reductase 2 (TAIR:AT1G37130.1); Has 14813 Blast hits to 14437 proteins in 2198 species: Archae - 168; Bacteria - 6976; Metazoa - 1728; Fungi - 2215; Plants - 1479; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 2244 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:29236005..29239367 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 103046.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 917 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATSVDNRHY PTMNGVAHAF KPPLVPSPRS FDRHRHQNQT LDVILTETKI VKETEVITTV VDSYDDSSSD DEDESHNRNV PYYKELVKKS NSDLEPSILD 101: PRDESTADSW IQRNSSMLRL TGKHPFNAEA PLPRLMHHGF ITPVPLHYVR NHGAVPKANW SDWSIEITGL VKRPAKFTME ELISEFPSRE FPVTLVCAGN 201: RRKEQNMVKQ TIGFNWGSAG VSTSLWKGIP LSEILRRCGI YSRRGGALNV CFEGAEDLPG GGGSKYGTSI KKEMAMDPAR DIILAYMQNG ELLTPDHGFP 301: VRVIVPGFIG GRMVKWLKRI IVTPQESDSY YHYKDNRVLP SLVDAELANS EAWWYKPEYI INELNINSVI TTPGHAEILP INAFTTQKPY TLKGYAYSGG 401: GKKVTRVEVT LDGGDTWSVC ELDHQEKPNK YGKFWCWCFW SLDVEVLDLL SAKDVAVRAW DESFNTQPDK LIWNLMGMMN NCWFRIRTNV CKPHRGEIGI 501: VFEHPTRPGN QSGGWMAKER QLEISSESNN TLKKSVSSPF MNTASKMYSI SEVRKHNTAD SAWIIVHGHI YDCTRFLKDH PGGTDSILIN AGTDCTEEFE 601: AIHSDKAKKL LEDYRIGELI TTGYDSSPNV SVHGASNFGP LLAPIKELTP QKNIALVNPR EKIPVRLIEK TSISHDVRKF RFALPSEDQQ LGLPVGKHVF 701: VCANINDKLC LRAYTPTSAI DAVGHIDLVV KVYFKDVHPR FPNGGLMSQH LDSLPIGSMI DIKGPLGHIE YKGKGNFLVS GKPKFAKKLA MLAGGTGITP 801: IYQIIQSILS DPEDETEMYV VYANRTEDDI LVREELEGWA SKHKERLKIW YVVEIAKEGW SYSTGFITEA VLREHIPEGL EGESLALACG PPPMIQFALQ 901: PNLEKMGYNV KEDLLIF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)