AT2G35520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.920 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Defender against death (DAD family) protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
DEFENDER AGAINST CELL DEATH 2 (DAD2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Defender against death DAD protein (InterPro:IPR003038); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Defender against death (DAD family) protein (TAIR:AT1G32210.1); Has 458 Blast hits to 458 proteins in 196 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 197; Fungi - 115; Plants - 102; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 44 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:14921587..14922657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 12647.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 115 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVKSTSKDAQ DLFHSLHSAY TATPTNLKII DLYVCFAVFT ALIQVAYMAL VGSFPFNSFL SGVLSCIGTA VLAVCLRIQV NKENKEFKDL APERAFADFV 101: LCNLVLHLVI INFLG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)