AT2G47600.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : magnesium/proton exchanger | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a magnesium/proton exchanger, member of putative Na+/Ca2+ antiporter gene family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
magnesium/proton exchanger (MHX); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sodium/calcium exchanger membrane region (InterPro:IPR004837); Has 2505 Blast hits to 2112 proteins in 583 species: Archae - 12; Bacteria - 368; Metazoa - 1819; Fungi - 7; Plants - 67; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 232 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:19524518..19526828 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59795.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 539 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASILNQTQE LQESSKVLGH LRCENFFLFP GENTLSDGLR GVLYFLGLAY CFIGLSAITA RFFKSMENVV KHSRKVVTID PITKAEVITY KKVWNFTIAD 101: ISLLAFGTSF PQISLATIDA IRNMGERYAG GLGPGTLVGS AAFDLFPIHA VCVVVPKAGE LKKISDLGVW LVELVWSFWA YIWLYIILEV WSPNVITLVE 201: ALLTVLQYGL LLVHAYAQDK RWPYLSLPMS RGDRPEEWVP EEIDTSKDDN DNDVHDVYSD AAQDAVESGS RNIVDIFSIH SANNDTGITY HTVADTPPDS 301: ATKKGKAKNS TVFDIWKHQF VDAITLETSE SKKVDSIYLR IAKSFWHLLL APWKLLFAFV PPCNIAHGWI AFICSLLFIS GVAFVVTRFT DLISCVTGIN 401: PYVIAFTALA SGTSWPDLVA SKIAAERQLT ADSAIANITC SNSVNIYVGI GVPWLINTVY NYFAYREPLY IENAKGLSFS LLIFFATSVG CIVVLVLRRL 501: IIGAELGGPR LWAWLTSAYF MMLWVVFVVL SSLKVSGVI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)