AT2G02970.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.983 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GDA1/CD39 nucleoside phosphatase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
GDA1/CD39 nucleoside phosphatase family protein; FUNCTIONS IN: hydrolase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleoside phosphatase GDA1/CD39 (InterPro:IPR000407); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GDA1/CD39 nucleoside phosphatase family protein (TAIR:AT1G14230.1); Has 1462 Blast hits to 1454 proteins in 233 species: Archae - 0; Bacteria - 37; Metazoa - 611; Fungi - 316; Plants - 335; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 163 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:865395..868007 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61291.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 555 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRRSHARSRV KNSSSSKSDM DPIKFQIRSG NRAPSSSSTY TLTKPNSKHA KSNLLLTVGS ISVVLGVLFL CYSILFSGGN LRGSLRYSVV IDGGSTGTRI 101: HVFGYRIESG KPVFEFRGAN YASLKLHPGL SAFADDPDGA SVSLTELVEF AKGRVPKGMW IETEVRLMAT AGMRLLELPV QEKILGVARR VLKSSGFLFR 201: DEWASVISGS DEGVYAWVVA NFALGSLGGD PLKTTGIVEL GGASAQVTFV SSEPMPPEFS RTISFGNVTY NLYSHSFLHF GQNAAHDKLW GSLLSRDHNS 301: AVEPTREKIF TDPCAPKGYN LDANTQKHLS GLLAEESRLS DSFQAGGNYS QCRSAALTIL QDGNEKCSYQ HCSIGSTFTP KLRGRFLATE NFFYTSKFFG 401: LGEKAWLSNM ISAGERFCGE DWSKLRVKDP SLHEEDLLRY CFSSAYIVSL LHDTLGIPLD DERIGYANQA GDIPLDWALG AFIQQTATET SQHAASGNLH 501: WFHALFSNHP KTLHYLIGIP ILMTVLVYLV TKWRKPQLKT IYDLEKGRYI VTRIR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)