AT1G53580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glyoxalase II 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Mononuclear Fe(II)-containing member of the b-lactamase fold superfamily. ETHE1 is homodimeric in solution, exhibits low-level esterase activity, and specifically binds a single Fe(II) atom in the active site. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glyoxalase II 3 (GLY3); FUNCTIONS IN: hydrolase activity, acting on ester bonds, hydroxyacylglutathione hydrolase activity; INVOLVED IN: response to salt stress, methylglyoxal catabolic process to D-lactate; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Beta-lactamase-like (InterPro:IPR001279); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein (TAIR:AT3G10850.1); Has 13610 Blast hits to 13607 proteins in 2472 species: Archae - 279; Bacteria - 8978; Metazoa - 399; Fungi - 229; Plants - 189; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3536 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:19991542..19993250 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32333.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 294 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVMTHFSRLR QLLLLQPKFL SSQPRPLRSP PPTFLRSVMG SSSSFSSSSS KLLFRQLFEN ESSTFTYLLA DVSHPDKPAL LIDPVDKTVD RDLKLIDELG 101: LKLIYAMNTH VHADHVTGTG LLKTKLPGVK SVISKASGSK ADLFLEPGDK VSIGDIYLEV RATPGHTAGC VTYVTGEGAD QPQPRMAFTG DAVLIRGCGR 201: TDFQEGSSDQ LYESVHSQIF TLPKDTLIYP AHDYKGFEVS TVGEEMQHNP RLTKDKETFK TIMSNLNLSY PKMIDVAVPA NMVCGLQDVP SQAN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)