AT2G01490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.394 golgi 0.218 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein; FUNCTIONS IN: phytanoyl-CoA dioxygenase activity; INVOLVED IN: N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phytanoyl-CoA dioxygenase (InterPro:IPR008775); Has 2926 Blast hits to 2921 proteins in 334 species: Archae - 4; Bacteria - 485; Metazoa - 347; Fungi - 101; Plants - 64; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1925 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:221316..223187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32029.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 283 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGITGSLTPD QLDFFHSQGY LVIESFASED EIRGLRKRMD ELLNQFDCSV SSIFSTKNQK HTTDNYFFES AEKISFFFEE KAFGDDGKLK QPKQLSINKV 101: GHALHELDPL YKDFTYSSKF SSLASSLGYR RPVVMQSMYI FKQPGIGGEV VPHQDNSFVY TDPQSCTGLW IALEDSTLVN GCLWAIPGSH KNGLVRRFIR 201: GDNGITFDQP SPSYEQKDFV SIEMKAGSLI AIHGDLIHQS FENLSSKSRH AYSLHVVESD GCKWAKDNWI QRAKMPEPLY VLP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)