AT3G21580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cobalt ion transmembrane transporters | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
cobalt ion transmembrane transporters; FUNCTIONS IN: cobalt ion transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: cobalt ion transport, cobalamin biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cobalt transport protein (InterPro:IPR003339); Has 2014 Blast hits to 2014 proteins in 922 species: Archae - 36; Bacteria - 1790; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 44; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 144 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:7602009..7603720 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42940.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 391 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNHSNLANPT VSLTVTLIPK HPIRHLTSPI PNRNFTNPKL LFPLRLNETP SSSLAAKRVF IVRATVDGDG KTGNWVNRLP IPGLGAENVF RLISSATGSP 101: IGQFISSPVT FLHSVDPRIK LVWLLTLVVL PARANLVVRL GLVLCTALLS ILVLPRQVWI DQLARVSLLS GILFITLGLG SDGAPPMLQS RTPPSSITSL 201: PNLPMSLSGY SYMLLKLGPL QFTRKGLSVG STAACLTFII FQSASICLAT TTPEQLALAL RWFLFPLTYI GVPVSEIILT LLLSLRFINL VFDEVRSVSL 301: GIVSRRVNWQ QLTVLETLDI FASFIRRIFK NIFRHAEQIS QAMIVRGFRG ESSSHKIYFF SGSSNKFADF ASVLCLIGVI STALLSEYFL V |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)