AT4G30850.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.961 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : heptahelical transmembrane protein2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
heptahelical transmembrane protein homologous to human adiponectin receptors and progestin receptors | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
heptahelical transmembrane protein2 (HHP2); FUNCTIONS IN: receptor activity; INVOLVED IN: response to hormone stimulus, response to sucrose stimulus; LOCATED IN: integral to membrane; EXPRESSED IN: 6 plant structures; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Hly-III related (InterPro:IPR004254); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: heptahelical protein 3 (TAIR:AT2G24150.1); Has 1891 Blast hits to 1806 proteins in 387 species: Archae - 0; Bacteria - 348; Metazoa - 867; Fungi - 353; Plants - 188; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 135 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:15020540..15022278 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41027.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 358 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQKRRTVKES TKIRNGKGMD SGEKKRSEKR LMKFEELPRY LKDNEFIHNH YRCEWSIKET FLSAFSWHNE TLNIWTHLCG FAIFTWMMVV SSMETTELGL 101: AGFVSLLSGA TIRWPWPSMA MSKDVYFSSD QTLHHDLNVT HTRSLLNSQG DVNYEAIPKW PWLVFLTGAM GCLICSSMSH LFACHSRRFN LFFWRLDYAG 201: ISLMIVCSFF APIYYAFSCH TYWRLFYLSS ISILGLLAIF TLLSPSLSAP RFRSFRAALF LTMGFSGVIP ATHVLYLHKD HPNVLIALVY ELAMAVLYAT 301: GAAFYVTRIP ERWKPGAFDI AGHSHQIFHV FVVLGALAHS VASLLIMDFR RASPSCAF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)