AT2G26300.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : G protein alpha subunit 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an alpha subunit of a heterotrimeric GTP-binding protein. The active GTP-bound form of GPA1 binds to the GTG1 and GTG2 abscisic acid (ABA) receptors and appears to affect their GTPase and GTP-binding activity, and hence, ABA binding abilities. GPA1 is a positive regulator in ABA-mediated inhibition of stomatal opening. Plants with recessive mutant alleles have complex phenotypes including: reduced brassinolide response, reduced cell divisions, round leaves, short hypocotyls. It is likely to be involved in the signaling events that trigger unfolded protein response-associated cell death. GPA1 is also involved in sugar signaling. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
G protein alpha subunit 1 (GP ALPHA 1); FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: in 16 processes; LOCATED IN: plasma membrane, endoplasmic reticulum membrane, heterotrimeric G-protein complex; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plant G-protein, alpha subunit (InterPro:IPR002976), Guanine nucleotide binding protein (G-protein), alpha subunit (InterPro:IPR001019), G protein alpha subunit, helical insertion (InterPro:IPR011025); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: extra-large GTP-binding protein 3 (TAIR:AT1G31930.3); Has 3745 Blast hits to 3647 proteins in 408 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 2360; Fungi - 766; Plants - 268; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 351 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:11198087..11200822 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44548.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 383 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGLLCSRSRH HTEDTDENTQ AAEIERRIEQ EAKAEKHIRK LLLLGAGESG KSTIFKQIKL LFQTGFDEGE LKSYVPVIHA NVYQTIKLLH DGTKEFAQNE 101: TDSAKYMLSS ESIAIGEKLS EIGGRLDYPR LTKDIAEGIE TLWKDPAIQE TCARGNELQV PDCTKYLMEN LKRLSDINYI PTKEDVLYAR VRTTGVVEIQ 201: FSPVGENKKS GEVYRLFDVG GQRNERRKWI HLFEGVTAVI FCAAISEYDQ TLFEDEQKNR MMETKELFDW VLKQPCFEKT SFMLFLNKFD IFEKKVLDVP 301: LNVCEWFRDY QPVSSGKQEI EHAYEFVKKK FEELYYQNTA PDRVDRVFKI YRTTALDQKL VKKTFKLVDE TLRRRNLLEA GLL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)