AT1G48270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : G-protein-coupled receptor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a protein similar to G-coupled receptor with 7 transmembrane regions. Overexpression studies suggest this gene is involved in dormancy and flowering. Reduction of expression results in decreased sensitivity to cytokinin. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
G-protein-coupled receptor 1 (GCR1); FUNCTIONS IN: G-protein coupled receptor activity; INVOLVED IN: in 7 processes; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: G-protein-coupled receptor, GCR1 putative (InterPro:IPR022340), GPCR, family 2-like (InterPro:IPR017981), GCR1-cAMP receptor (InterPro:IPR022343); Has 592 Blast hits to 590 proteins in 111 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 324; Fungi - 88; Plants - 42; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 138 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:17828314..17830214 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37250.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 326 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSAVLTAGGG LTAGDRSIIT AINTGASSLS FVGSAFIVLC YCLFKELRKF SFKLVFYLAL SDMLCSFFLI VGDPSKGFIC YAQGYTTHFF CVASFLWTTT 101: IAFTLHRTVV KHKTDVEDLE AMFHLYVWGT SLVVTVIRSF GNNHSHLGPW CWTQTGLKGK AVHFLTFYAP LWGAILYNGF TYFQVIRMLR NARRMAVGMS 201: DRVDQFDNRA ELKVLNRWGY YPLILIGSWA FGTINRIHDF IEPGHKIFWL SVLDVGTAAL MGLFNSIAYG FNSSVRRAIH ERLELFLPER LYRWLPSNFR 301: PKNHLILHQQ QQQRSEMVSL KTEDQQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)