AT3G46180.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.664 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-galactose transporter 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
UDP-galactose transporter 5 (UTR5); FUNCTIONS IN: galactose transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: transmembrane transport; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UAA transporter (InterPro:IPR013657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-N-acetylglucosamine (UAA) transporter family (TAIR:AT5G59740.1); Has 1091 Blast hits to 1089 proteins in 231 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 540; Fungi - 180; Plants - 207; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 160 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:16954671..16956800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38862.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 347 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEPDSVNEA KEKKKKLWKA VFAISGIMLT LVIYGLLQEK IMRVPYGLKK EYFKHSLFLV FCNRLTTSAV SAAALLASKK VLDPVAPVYK YCLISVTNIL 101: TTTCQYEALK YVSFPVQTLA KCAKMIPVMV WGTLIMQKKY RGFDYLVAFL VTLGCSVFIL FPAGDDISPY NKGRENTVWG VSLMVGYLGF DGFTSTFQDK 201: LFKGYNMEIH NQIFYTTICS SILSFTGLIL QGHLLPAVDF VSRHRDCLFD IALLSTVATA SQFFISYTIR TFGALTFAAI MTTRQLASIM LSCIWFSHPL 301: SWEQCIGSVI VFGSLYAKTF VKKKSEKPPA AQELPRDEEA QPLKGNP |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)