AT1G71900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.943 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein of unknown function (DUF803) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein of unknown function (DUF803); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF803 (InterPro:IPR008521); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein of unknown function (DUF803) (TAIR:AT1G34470.1); Has 1265 Blast hits to 1244 proteins in 219 species: Archae - 0; Bacteria - 92; Metazoa - 420; Fungi - 372; Plants - 263; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 118 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27061754..27064053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37475.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 343 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAESSGSWRD SYKGMSSDNI KGLVLALSSS LFIGASFIVK KKGLKKAAST GTRAGVGGYS YLYEPLWWIG MTTMLLGEIA NFAAYAFAPA ILVTPLGAVS 101: IIISAVLAHI ILREKLHIFG ILGCALCVVG STTIVLHAPQ EREIDSVIEV WNLATEPAFM FYASLVIGAA VFLIIRFVPQ YGQTNVMVYI GICSLVGSLS 201: VMSVKALGIA LKLTFSGTNQ LFYPQTWIFT LVVLTCVVTQ LNYLNKALDT FNTAIVSPIY YVMFTSLTIL ASVIMFKDWD RQNGTQIVTE ICGFVTILSG 301: TFLLHRTKDM VEGSSVILPL RISKHINEEE GIPLRRQESL RSP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)