AT2G34410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.951 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : O-acetyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
O-acetyltransferase family protein; FUNCTIONS IN: O-acetyltransferase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: cultured cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cas1p-like (InterPro:IPR012419); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: O-acetyltransferase family protein (TAIR:AT1G29890.2); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:14518719..14522053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63334.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 540 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADSQPITPG QVSFLLGVIP VFIAWIYSEF LEYKRSSLHS KVHSDNNLVE LGEVKNKEDE GVVLLEGGLP RSVSTKFYNS PIKTNLIRFL TLEDSFLIEN 101: RATLRAMAEF GAILFYFYIS DRTSLLGESK KNYNRDLFLF LYCLLIIVSA MTSLKKHNDK SPITGKSILY LNRHQTEEWK GWMQVLFLMY HYFAAAEIYN 201: AIRVFIAAYV WMTGFGNFSY YYIRKDFSLA RFTQMMWRLN LFVAFSCIIL NNDYMLYYIC PMHTLFTLMV YGALGIFSRY NEIPSVMALK IASCFLVVIV 301: MWEIPGVFEI FWSPLTFLLG YTDPAKPELP LLHEWHFRSG LDRYIWIIGM IYAYFHPTVE RWMEKLEECD AKRKMSIKTS IIAISSFVGY LWYEYIYKLD 401: KVTYNKYHPY TSWIPITVYI CLRNSTQQLR NFSMTLFAWL GKITLETYIS QFHIWLRSNV PNGQPKWLLC IIPEYPMLNF MLVTAIYVLV SHRLFELTNT 501: LKSVFIPTKD DKRLLHNVLA GAAISFCLYL TSLILLQIPH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)