AT3G59360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.921 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-galactose transporter 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-galactose transporter 6 (UTR6); FUNCTIONS IN: nucleotide-sugar transmembrane transporter activity, sugar:hydrogen symporter activity; INVOLVED IN: carbohydrate transport, nucleotide-sugar transport; LOCATED IN: integral to membrane, Golgi membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleotide-sugar transporter (InterPro:IPR007271), UDP/CMP-sugar transporter (InterPro:IPR021189); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nucleotide-sugar transporter family protein (TAIR:AT2G43240.1); Has 997 Blast hits to 971 proteins in 170 species: Archae - 0; Bacteria - 8; Metazoa - 550; Fungi - 106; Plants - 185; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 148 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:21935826..21939642 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44544.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 405 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKNGIAECPA CHSKLVSPGS KTISRAYDDH KIRVSSKQRV LNVLLVVGDC MLVGLQPVLV YMSKVDGKFN FSPISVNFLT EIAKVIFAIV MLLIQARHQK 101: VGEKPLLSVS TFVQAARNNV LLAVPALLYA INNYLKFTMQ LYFNPATVKM LSNLKVLVIA VLLKMVMKRR FSIIQWEALA LLLIGISVNQ LRSLPEGATA 201: IGIPLATGAY VCTVIFVTVP SMASVFNEYA LKSQYDTSIY LQNLFLYGYG AIFNFLGILG TVIYKGPGSF DILQGHSRAT MFLILNNAAQ GILSSFFFKY 301: ADTILKKYSS TVATIFTGIA SAALFGHVIT MNFLLGISIV FISMHQFFSP LAKARDEQQQ NGNLELGNTK DTHRANESFI NMAAGANEEA SHRGESDDRT 401: PLLPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)