AT4G37680.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.730 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : heptahelical protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
heptahelical transmembrane protein HHP4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
heptahelical protein 4 (HHP4); FUNCTIONS IN: receptor activity; INVOLVED IN: response to hormone stimulus, response to sucrose stimulus; LOCATED IN: integral to membrane; EXPRESSED IN: stem, fruit, root, flower, leaf; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Hly-III related (InterPro:IPR004254); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: heptahelical protein 5 (TAIR:AT4G38320.1); Has 2914 Blast hits to 2455 proteins in 684 species: Archae - 0; Bacteria - 947; Metazoa - 1116; Fungi - 462; Plants - 204; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 185 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:17701231..17702568 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44174.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 385 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGDEAEIKEH LKPQASSETM DKKHNVKGKR LWQKVKYQLV EFHSLPAYLR DNEYIIGHYR SEWPIKQILL SIFTIHNETL NVWTHLIGFF LFLALTIYTA 101: TKVPSVVDLH SLQHRLPDLL RKTDLHKLHS ELMARLPSSP SSWHVMDLLY NCLPERFSHG NYTDMCVLHS VREDLANLIA PLIFRPITRW PFYAFLGGAM 201: FCLLASSTCH LLSCHSERVS YIMLRLDYAG IAALIATSFY PPVYYSFMCD PFFCNLYLGF ITILGIATVL VSLLPVFQSP EFRVVRASLF FGMGFSGLAP 301: ILHKLIIFWD QPEALHTTGY EILMGLLYGL GALVYATRIP ERWMPGKFDI AGHSHQLFHV LVVAGAFTHY RAGLVYLKWR DIEGC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)