AT4G14455.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 ASURE: golgi What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Target SNARE coiled-coil domain protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a Bet1/Sft1-like SNARE protein, which can only partially suppresses the temperature-sensitive growth defect in <i>sft1-1</i> yeast cells; however, it cannot support the deletion of the yeast BET1 gene (<i>bet1Δ</i>). In yeast, Bet1p is the v-SNARE (soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor adaptor protein receptor, V-type) involved in trafficking between the ER and Golgi. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATBET12; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Target SNARE coiled-coil domain (InterPro:IPR000727); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: BET1P/SFT1P-like protein 14A (TAIR:AT3G58170.1); Has 338 Blast hits to 337 proteins in 95 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 144; Fungi - 35; Plants - 128; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 31 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:8310482..8311938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15208.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 130 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNFRRENRAS RTSLFDGLDG LEEGRLRASS SYAHDERDND EALENLQDRV SFLKRVTGDI HEEVENHNRL LDKVGNKMDS ARGIMSGTIN RFKLVFEKKS 101: NRKSCKLIAY FVLLFLIMYY LIRLLNYIKG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)